| タイトル（別表記） | Sexuality in plants, unveiled from genome evolution |
|---|---|
| フルテキストURL | srfa_109_037_040.pdf |
| 著者 | 赤木 剛士| |
| 抄録 | Sexual polymorphism, a main strategy to maintain genetic diversity within a species, has long been a major focus in biology. Notwithstanding, in plants, evolution of sexual systems and mechanisms underlying these transitions have been little unveiled. We have elucidated the molecular mechanism of sex determination in persimmons (Diospyros spp.), where the Y-encoded smRNA gene OGI can repress the female-determining gene MeGI, and also in kiwifruits (Actinidia spp.), where the Y-encoded two sex determinants, Shy Girl and Friendly Boy, control gynoecium and androecium development, respectively. Although the molecular functions of these determinants are distinct, they have common evolutionary scenarios involving transitions of sexual systems. In persimmon, a recent genome triplication (hexaploidization) in cultivated persimmon (D. kaki) derived “flexible” sexuality via establishing epigenetic layers on the two sex determinants. On the other hand, an ancient Diospyros-specific paleo-genome duplication (paleo-tetraploidization) enabled neofunctionalization in the proto-MeGI, via positive selection, to establish a new function as a sex determinant. In kiwifruit, one of the two sex determinants, Shy Girl, was derived from neofunctionalization via Actinidia-specific duplication event. These findings exemplify how plant-specific numerous duplication events can drive flexible genetic material whose variation can be selected for development of new sexual systems. |
| キーワード | Sex determination Sex chromosome Polyploidization Genome evolution Tree crops |
| 出版物タイトル | 岡山大学農学部学術報告 |
| 発行日 | 2020-02-01 |
| 巻 | 109巻 |
| 開始ページ | 37 |
| 終了ページ | 40 |
| ISSN | 2186-7755 |
| 言語 | 日本語 |
| 論文のバージョン | publisher |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Akagi, Takashi| Shirasawa, Kenta| Nagasaki, Hideki| Hirakawa, Hideki| Tao, Ryutaro| Comai, Luca| Henry, Isabelle M.| |
| 発行日 | 2020-02-18 |
| 出版物タイトル | PLoS Genetics |
| 巻 | 16巻 |
| 号 | 2号 |
| 出版者 | Public Library of Science |
| 開始ページ | e1008566 |
| ISSN | 1553-7404 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2020 Akagi et al. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 32069274 |
| DOI | 10.1371/journal.pgen.1008566 |
| Web of Science KeyUT | 000519137100008 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008566 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Mitalo, Oscar W.| Otsuki, Takumi| Okada, Rui| Obitsu, Saeka| Masuda, Kanae| Hojo, Yuko| Matsuura, Takakazu| Mori, Izumi C.| Abe, Daigo| Asiche, William O.| Akagi, Takashi| Kubo, Yasutaka| Ushijima, Koichiro| |
| キーワード | 1-methylcyclopropene carotenoids chlorophyll Citrus limon ethylene low temperature peel degreening phytohormones transcriptome |
| 発行日 | 2020-05-06 |
| 出版物タイトル | Journal of Experimental Botany |
| 巻 | 71巻 |
| 号 | 16号 |
| 出版者 | Oxford University Press |
| 開始ページ | 4778 |
| 終了ページ | 4796 |
| ISSN | 0022-0957 |
| NCID | AA00697526 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2020. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 32374848 |
| DOI | 10.1093/jxb/eraa206 |
| Web of Science KeyUT | 000573250000015 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/jxb/eraa206 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Masuda, Kanae| Yamamoto, Eiji| Shirasawa, Kenta| Onoue, Noriyuki| Kono, Atsushi| Ushijima, Koichiro| Kubo, Yasutaka| Tao, Ryutaro| Henry, Isabelle M.| Akagi, Takashi| |
| キーワード | flexible sexuality monoecy polyploid GWAS |
| 発行日 | 2020-06-17 |
| 出版物タイトル | DNA Research |
| 巻 | 27巻 |
| 号 | 3号 |
| 出版者 | OXFORD UNIV PRESS |
| 開始ページ | dsaa012 |
| ISSN | 1340-2838 |
| NCID | AA11095219 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2020. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 32761076 |
| DOI | 10.1093/dnares/dsaa012 |
| Web of Science KeyUT | 000577169400006 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/dnares/dsaa012 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Masuda, Kanae| Fujita, Naoko| Yang, Ho-Wen| Ushijima, Koichiro| Kubo, Yasutaka| Tao, Ryutaro| Akagi, Takashi| |
| キーワード | monoecious sex expression polyploidy Oriental persimmon co-expression network |
| 発行日 | 2020-12-22 |
| 出版物タイトル | Frontiers in Plant Science |
| 巻 | 11巻 |
| 出版者 | Frontiers Media |
| 開始ページ | 567249 |
| ISSN | 1664-462X |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2020 Masuda, Fujita, Yang, Ushijima, Kubo, Tao and Akagi. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 33414795 |
| DOI | 10.3389/fpls.2020.567249 |
| Web of Science KeyUT | 000604603500001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.3389/fpls.2020.567249 |
| フルテキストURL | 91_UTD-323.pdf |
|---|---|
| 著者 | Suzuki, Maria| Masuda, Kanae| Asakuma, Hideaki| Takeshita, Kouki| Baba, Kohei| Kubo, Yasutaka| Ushijima, Koichiro| Uchida, Seiichi| Akagi, Takashi| |
| 発行日 | 2022 |
| 出版物タイトル | The Horticulture Journal |
| 巻 | 91巻 |
| 号 | 3号 |
| 出版者 | Japanese Society for Horticultural Science |
| ISSN | 2189-0102 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2022 The Japanese Society for Horticultural Science (JSHS) |
| 論文のバージョン | author |
| DOI | 10.2503/hortj.utd-323 |
| Web of Science KeyUT | 000828874700001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.2503/hortj.utd-323 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Mitalo, Oscar W.| Asiche, William O.| Kang, Seung W.| Ezura, Hiroshi| Akagi, Takashi| Kubo, Yasutaka| Ushijima, Koichiro| |
| キーワード | chlorophyll citrus degreening ethylene RNA-Seq on-tree storage |
| 発行日 | 2022-07-13 |
| 出版物タイトル | Frontiers In Plant Science |
| 巻 | 13巻 |
| 出版者 | Frontiers Media SA |
| 開始ページ | 918226 |
| ISSN | 1664-462X |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2022 Mitalo, Asiche, Kang, Ezura, Akagi, Kubo and Ushijima. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 35909736 |
| DOI | 10.3389/fpls.2022.918226 |
| Web of Science KeyUT | 000832990000001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.3389/fpls.2022.918226 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Tominaga, Yuki| Sakurai, Yusuke| Miyata, Junya| Harada, Shuichi| Akagi, Takashi| Oita, Masataka| |
| キーワード | commissioning lateral penumbra multi-leaf collimator pencil beam scanning proton therapy |
| 発行日 | 2022-11-24 |
| 出版物タイトル | Journal Of Applied Clinical Medical Physics |
| 巻 | 23巻 |
| 出版者 | Wiley |
| 開始ページ | e13817 |
| ISSN | 1526-9914 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2022 The Authors. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 36420959 |
| DOI | 10.1002/acm2.13817 |
| Web of Science KeyUT | 000889306500001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1002/acm2.13817 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Akagi, Takashi| Jung, Katharina| Masuda, Kanae| Shimizu, Kentaro K.| |
| キーワード | Polyploidy Domestication Crops Self-compatibility |
| 発行日 | 2022-10 |
| 出版物タイトル | Current Opinion in Plant Biology |
| 巻 | 69巻 |
| 出版者 | Elsevier |
| 開始ページ | 102255 |
| ISSN | 13695266 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © 2022 The Author(s). |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 35870416 |
| DOI | 10.1016/j.pbi.2022.102255 |
| Web of Science KeyUT | 000853245700003 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.pbi.2022.102255 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Horiuchi, Ayano| Masuda, Kanae| Shirasawa, Kenta| Onoue, Noriyuki| Fujita, Naoko| Ushijima, Koichiro| Akagi, Takashi| |
| キーワード | sex chromosome genome assembly monoecy transposable elements |
| 発行日 | 2023-07-07 |
| 出版物タイトル | Molecular Biology and Evolution |
| 巻 | 40巻 |
| 号 | 7号 |
| 出版者 | Oxford University Press |
| 開始ページ | msad151 |
| ISSN | 0737-4038 |
| NCID | AA10643104 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2023. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 37414545 |
| DOI | 10.1093/molbev/msad151 |
| Web of Science KeyUT | 001029882200001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/molbev/msad151 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Horiuchi, Ayano| Masuda, Kanae| Shirasawa, Kenta| Onoue, Noriyuki| Matsuzaki, Ryusuke| Tao, Ryutaro| Kubo, Yasutaka| Ushijima, Koichiro| Akagi, Takashi| |
| キーワード | fruit shape astringency polyploid population structure GWAS |
| 発行日 | 2023-06-16 |
| 出版物タイトル | DNA Research |
| 巻 | 30巻 |
| 号 | 5号 |
| 出版者 | Oxford University Press |
| 開始ページ | dsad015 |
| ISSN | 1340-2838 |
| NCID | AA11095219 |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2023. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 37326063 |
| DOI | 10.1093/dnares/dsad015 |
| Web of Science KeyUT | 001059198000001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/dnares/dsad015 |
| フルテキストURL | fulltext.pdf |
|---|---|
| 著者 | Masuda, Kanae| Kuwada, Eriko| Suzuki, Maria| Suzuki, Tetsuya| Niikawa, Takeshi| Uchida, Seiichi| Akagi, Takashi| |
| キーワード | Artificial intelligence Backpropagation Convolutional neural network Image diagnosis Physiological disorder |
| 発行日 | 2023-05-24 |
| 出版物タイトル | Plant And Cell Physiology |
| 巻 | 64巻 |
| 号 | 11号 |
| 出版者 | Oxford University Press (OUP) |
| 開始ページ | 1323 |
| 終了ページ | 1330 |
| ISSN | 0032-0781 |
| NCID | AA0077511X |
| 資料タイプ | 学術雑誌論文 |
| 言語 | 英語 |
| OAI-PMH Set | 岡山大学 |
| 著作権者 | © The Author(s) 2023. |
| 論文のバージョン | publisher |
| PubMed ID | 37225398 |
| DOI | 10.1093/pcp/pcad050 |
| Web of Science KeyUT | 001003754000001 |
| 関連URL | isVersionOf https://doi.org/10.1093/pcp/pcad050 |