甲賀研一郎

Hydronium Ions Are Less Excluded from Hydrophobic Polymer–Water Interfaces than Hydroxide Ions

著者	Myers, Ryan L.\| Taira, Aoi\| Yan, Chuanyu\| Lee, Seung-Yi\| Welsh, Lauren K.\| Ianiro, Patrick R.\| Yang, Tinglu\| Koga, Kenichiro\| Cremer, Paul S.\|
備考	This document is the Accepted Manuscript version of a Published Work that appeared in final form in The Journal of Physical Chemistry B, copyright © 2024 American Chemical Society after peer review and technical editing by the publisher. To access the final edited and published work see https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c05748.\| This fulltext file will be available in Dec. 2025.\|
発行日	2024-12-31
出版物タイトル	The Journal of Physical Chemistry B
巻	129巻
号	2号
出版者	American Chemical Society (ACS)
開始ページ	726
終了ページ	735
ISSN	1520-6106
NCID	AA11114073
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 American Chemical Society
論文のバージョン	author
PubMed ID	39737869
DOI	10.1021/acs.jpcb.4c05748
Web of Science KeyUT	001387010200001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c05748

The nature of the hydrophobic interaction varies as the solute size increases from methane’s to C60’s

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Naito, Hidefumi\| Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2024-12-02
出版物タイトル	The Journal of Chemical Physics
巻	161巻
号	21号
出版者	AIP Publishing
開始ページ	214501
ISSN	0021-9606
NCID	AA00694991
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	39620415
DOI	10.1063/5.0233808
Web of Science KeyUT	001368895000001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1063/5.0233808

Molecular mechanism of the common and opposing cosolvent effects of fluorinated alcohol and urea on a coiled coil protein

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nakata, Noa\| Okamoto, Ryuichi\| Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\| Morita, Takeshi\| Imamura, Hiroshi\|
キーワード	2,2,2-trifluoroethanol cosolvent effects preferential binding parameter protein folding stability urea
発行日	2023-09-25
出版物タイトル	Protein Science
巻	32巻
号	10号
出版者	Wiley
開始ページ	e4763
ISSN	0961-8368
NCID	AA10829011
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37622187
DOI	10.1002/pro.4763
Web of Science KeyUT	001083988800003
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1002/pro.4763

How do water-mediated interactions and osmotic second virial coefficients vary with particle size?

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Naito, Hidefumi\| Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2024
出版物タイトル	Faraday Discussions
巻	249巻
出版者	Royal Society of Chemistry (RSC)
開始ページ	440
終了ページ	452
ISSN	1359-6640
NCID	AA10836538
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Royal Society of Chemistry 2024
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37791511
DOI	10.1039/d3fd00104k
Web of Science KeyUT	001077081700001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/d3fd00104k

Close-Packed Ices in Nanopores

フルテキストURL	fulltext20240122-02.pdf
著者	Mochizuki, Kenji\| Adachi, Yuji\| Koga, Kenichiro\|
キーワード	Close-packed ices Ice nanotubes Carbon nanotubes Continuous freezing Ferroelectricices
発行日	2023-12-18
出版物タイトル	ACS Nano
巻	18巻
号	1号
出版者	American Chemical Society (ACS)
開始ページ	347
終了ページ	354
ISSN	1936-0851
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38109520
DOI	10.1021/acsnano.3c07084
Web of Science KeyUT	001139474500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acsnano.3c07084

Solvation free energies of alcohols in water: temperature and pressure dependences

フルテキストURL	fulltext20231129-01.pdf
著者	Taira, Aoi\| Okamoto, Ryuichi\| Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2023
出版物タイトル	Physical Chemistry Chemical Physics
巻	25巻
号	45号
出版者	Royal Society of Chemistry (RSC)
開始ページ	31107
終了ページ	31117
ISSN	1463-9076
NCID	AA11301773
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© the Owner Societies 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37947179
DOI	10.1039/d3cp03799a
Web of Science KeyUT	001099200400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/d3cp03799a

Osmotic second virial coefficients for hydrophobic interactions as a function of solute size

フルテキストURL	fulltext20220810-2.pdf
著者	Naito, Hidefumi\| Okamoto, Ryuichi\| Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\|
備考	This article may be downloaded for personal use only. Any other use requires prior permission of the author and AIP Publishing. This article appeared in (Hidefumi Naito, Ryuichi Okamoto, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga; Osmotic second virial coefficients for hydrophobic interactions as a function of solute size. J. Chem. Phys. 14 June 2022; 156 (22): 221104. https://doi.org/10.1063/5.0097547) and may be found at (https://doi.org/10.1063/5.0097547). This fulltext is available in June 2023.\|
発行日	2022-06-14
出版物タイトル	The Journal of Chemical Physics
巻	156巻
号	22号
出版者	AIP Publishing
開始ページ	221104
ISSN	0021-9606
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2022 Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	35705398
DOI	10.1063/5.0097547
Web of Science KeyUT	000832682400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1063/5.0097547

Theory of Gas Solubility and Hydrophobic Interaction in Aqueous Electrolyte Solutions

フルテキストURL	fulltext20220222-1.pdf SI20220222-1.pdf
著者	Okamoto, Ryuichi\| Koga, Kenichiro\|
備考	This document is the Accepted Manuscript version of a Published Work that appeared in final form in The Journal of Physical Chemistry B, copyright © American Chemical Society after peer review and technical editing by the publisher. To access the final edited and published work see https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c08050 .\|
発行日	2021-11-10
出版物タイトル	The Journal of Physical Chemistry B
巻	125巻
号	46号
出版者	American Chemical Society (ACS)
開始ページ	12820
終了ページ	12831
ISSN	1520-6106
NCID	AA11114073
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2021 American Chemical Society
論文のバージョン	author
PubMed ID	34756051
DOI	10.1021/acs.jpcb.1c08050
Web of Science KeyUT	000750898200015
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c08050

Ion Size Dependences of the Salting-Out Effect: Reversed Order of Sodium and Lithium Ions

フルテキストURL	fulltext20210803-3.pdf
著者	Katsuto, Hiroyuki\| Okamoto, Ryuichi\| Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\|
備考	This document is the Accepted Manuscript version of a Published Work that appeared in final form in [The Journal of Physical Chemistry B], copyright © American Chemical Society after peer review and technical editing by the publisher. To access the final edited and published work see https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c03388\|
発行日	2021-6-8
出版物タイトル	The Journal of Physical Chemistry B
巻	125巻
号	23号
出版者	American Chemical Society (ACS)
開始ページ	6296
終了ページ	6305
ISSN	1520-6106
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2021 American Chemical Society
論文のバージョン	author
PubMed ID	34102058
DOI	10.1021/acs.jpcb.1c03388
Web of Science KeyUT	000664303000026
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c03388

Structure and phase behavior of high-density ice from molecular-dynamics simulations with the ReaxFF potential

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Adachi, Yuji\| Koga, Kenichiro\|
備考	This article may be downloaded for personal use only. Any other use requires prior permission of the author and AIP Publishing. This article appeared in Yuji Adachi and Kenichiro Koga Structure and phase behavior of highdensity ice from molecular-dynamics simulations with the ReaxFF potential. J. Chem. Phys. 153, 114501 (2020) and may be found at https://doi.org/10.1063/5.0016565.\|
発行日	2020-09-16
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	153巻
号	11号
出版者	American Institute of Physics
開始ページ	114501
ISSN	0021-9606
NCID	AA00694991
資料タイプ	学術雑誌論文
著作権者	© 2020 Author(s)
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	32962394
DOI	10.1063/5.0016565
Web of Science KeyUT	000574657400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1063/5.0016565

Theoretical analysis on thermodynamic stability of chignolin

フルテキストURL	SR9_1_5186.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2019-3-26
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	9巻
出版者	Nature Publishing Group
開始ページ	5186
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2019
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	30914684
DOI	10.1038/s41598-019-41518-1
Web of Science KeyUT	000462298600073
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-019-41518-1

Three-phase equilibria in density-functional theory: Interfacial tensions

フルテキストURL	J_ChemPhys_150_16_164701_p.pdf J_ChemPhys_150_16_164701_a.pdf
著者	Koga, Kenichiro\| Indekeu, Joseph O.\|
発行日	2019-04-24
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	150巻
号	16号
出版者	American Institute of Physics
開始ページ	164701
ISSN	00219606
NCID	AA00694991
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	31042902
DOI	10.1063/1.5091599
Web of Science KeyUT	000466698700046
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1063/1.5091599

Application of reference-modified density functional theory: Temperature and pressure dependences of solvation free energy

フルテキストURL	J_ComputChem_39_4_202.pdf SI_J_ComputChem_39_4_202.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Maruyama, Yutaka\| Mitsutake, Ayori\| Mochizuki , Kenji\| Koga, Kenichiro\|
キーワード	3D-RISM theory chignolin classical density functional theory high-pressure unfolding hydrophobic solute protein temperature and pressure dependences of solvation free energy thermal denaturation
発行日	2017-11-08
出版物タイトル	Journal of Computational Chemistry
巻	39巻
号	4号
出版者	Wiley
開始ページ	202
終了ページ	217
ISSN	01928651
NCID	AA00257341
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	29116647
DOI	10.1002/jcc.25101
Web of Science KeyUT	000417850400002
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1002/jcc.25101

A reference-modified density functional theory: An application to solvation free-energy calculations for a Lennard-Jones solution

フルテキストURL	J_ChemPhys_144_22_224104.pdf
著者	Sumi, Tomonari\| Maruyama, Yutaka\| Mitsutake, Ayori\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2016-06-10
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	144巻
号	22号
出版者	American Institute of Physics
開始ページ	224104
ISSN	00219606
NCID	AA00694991
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	27305993
DOI	10.1063/1.4953191
Web of Science KeyUT	000378926100007
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1063/1.4953191

Solid-liquid critical behavior of water in nanopores

著者	望月建爾\| 甲賀研一郎\|
発行日	2015-07-07
出版物タイトル	Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
巻	112巻
号	27号
資料タイプ	学術雑誌論文

Line adsorption in a mean-field density functional model

著者	Koga, Kenichiro\| Widom, Benjamin\|
発行日	2006-10-01
出版物タイトル	Molecular Physics
巻	104巻
号	22-24号
資料タイプ	学術雑誌論文

Formation of ice nanotube with hydrophobic guests inside carbon nanotube

著者	Tanaka, Hideki\| Koga, Kenichiro\|
発行日	2005-09-01
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	123巻
号	9号
資料タイプ	学術雑誌論文

Line and boundary tensions on approach to the wetting transition

著者	Koga, Kenichiro\| Widom, B.\|
発行日	2007-08-14
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	127巻
号	6号
資料タイプ	学術雑誌論文

Close-packed structures and phase diagram of soft spheres in cylindrical pores

著者	Koga, Kenichiro\| Tanaka, Hideki\|
発行日	2006-04-07
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	124巻
号	13号
資料タイプ	学術雑誌論文

Phase diagram of water between hydrophobic surfaces

著者	Koga, Kenichiro\| Tanaka, Hideki\|
発行日	2005-03-08
出版物タイトル	Journal of Chemical Physics
巻	122巻
号	10号
資料タイプ	学術雑誌論文

甲賀 研一郎