検索結果 - 岡山大学学術成果リポジトリ

Novel in-frame duplication variant of SOD1 in a Japanese family with familial amyotrophic lateral sclerosis

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nakajima, Masanori\| Naruse, Hiroya\| Riku, Yuichi\| Ueda, Kunihiro\| Matsukawa, Takashi\| Mitsui, Jun\| Nakamura, Yoshitsugu\| Ishida, Shimon\| Yamada, Takashi\| Moro, Naoki\| Kotsuki, Naoki\| Nagai, Kentaro\| Tokushige, Shin-ichi\| Uchibori, Ayumi\| Oishi, Chizuko\| Yabata, Hiroyuki\| Urushitani, Makoto\| Iwasaki, Yasushi\| Ishiura, Hiroyuki\| Toda, Tatsushi\| Tsuji, Shoji\| Ichikawa, Yaeko\|
キーワード	Familial amyotrophic lateral sclerosis SOD1 in-frame duplication protein structure misfolded protein
発行日	2025-12-03
出版物タイトル	Amyotrophic Lateral Sclerosis and Frontotemporal Degeneration
出版者	Informa UK Limited
ISSN	2167-8421
NCID	AA12610401
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2025 The Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	40767357
DOI	10.1080/21678421.2025.2593302
Web of Science KeyUT	001629924500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1080/21678421.2025.2593302

COVID-19 and the Risks of Migraine and Headache: A Mendelian Randomization Study

JaLCDOI	10.18926/AMO/69843
フルテキストURL	79_6_413.pdf
著者	Jiang, Zhiyun\| Xi, Ying\|
抄録	Several observational studies suggested that migraine headache attacks were associated with coronavirus disease 2019 (COVID-19). We investigated genetic causal links between COVID-19 phenotypes and the development of headache and migraine, including migraine with aura (MA) and migraine without aura (MO). We conducted a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis to estimate the genetic association in European populations. The inverse-variance weighted (IVW) method was used as the main approach in the MR analyses, together with weighted median and MR-Egger methods. We also performed a series of sensitivity tests to assess the robustness of the MR results. The MR results demonstrated that COVID-19 severity, hospitalization, and susceptibility had no causal effect on the risks of headache, migraine, MA, or MO. No horizontal pleiotropy was detected, and the results were robust as supported by the sensitivity analysis findings. Our analyses identified no casual effect of COVID-19 severity, hospitalization, or susceptibility on the risks of headache or migraine in European populations.
キーワード	headache migraine Mendelian randomization COVID-19
Amo Type	Original Article
出版物タイトル	Acta Medica Okayama
発行日	2025-12
巻	79巻
号	6号
出版者	Okayama University Medical School
開始ページ	413
終了ページ	419
ISSN	0386-300X
NCID	AA00508441
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
著作権者	Copyright Ⓒ 2025 by Okayama University Medical School
論文のバージョン	publisher
査読	有り

Comparative Analysis of a Dual DNA–RNA Panel and a DNA-Only Panel for Sarcoma: Real-World Data From a Nationwide Genomic Database

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nakata, Eiji\| Ninomiya, Kiichiro\| Osone, Tatsunori\| Ennishi, Daisuke\| Tomida, Shuta\| Fujiwara, Tomohiro\| Kunisada, Toshiyuki\| Futagawa, Mashu\| Hirasawa, Akira\| Toyooka, Shinichi\| Ozaki, Toshifumi\|
キーワード	comprehensive cancer genomic profiling (CGP) fusion genes gene alterations genotype-matched therapy potential germline variants (PGVs)
発行日	2025-10-23
出版物タイトル	Cancer Science
出版者	Wiley
ISSN	1347-9032
NCID	AA11808050
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2025 The Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	41128349
DOI	10.1111/cas.70214
Web of Science KeyUT	001600038800001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1111/cas.70214

Oregon Wolfe barley genetic stocks – Research and teaching tools for next generation scientists

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Krause, Margaret R.\| Arbelaez, Juan David\| Asdal, Åsmund\| Belkodja, Ramzi\| Boury, Nancy\| Blake, Victoria C.\| Brown, Patrick J.\| Casas, Ana\| Cistué, Luis\| Farré‐Martínez, Alba\| Fisk, Scott\| Fuerst, Gregory S.\| Giménez, Estela\| Guijarro‐Real, Carla\| Guthrie, Katy\| Halstead, Margaret\| Helgerson, Laura\| Hisano, Hiroshi\| Igartua, Ernesto\| Lillemo, Morten\| Martínez‐García, Marina\| Martínez‐Subirà, Mariona\| McCouch, Susan\| McGhee, Laurie\| Nickols, Travis\| Peters, Nick\| Porter, Raymond\| Romagosa, Ignacio\| Ruud, Anja Karine\| Sato, Kazuhiro\| Salvi, Silvio\| Sangiorgi, Giuseppe\| Schüller, Rebekka\| Sen, Taner Z.\| Soriano, José Miguel\| Stupar, Robert M.\| Ting, To‐Chia\| Vining, Kelly\| von Korff, Maria\| Walla, Agatha\| Wang, Diane R.\| Waugh, Robbie\| Wise, Roger P.\| Wolfe, Robert\| Yao, Eric\| Hayes, Patrick M.\|
発行日	2025-09
出版物タイトル	Journal of Plant Registrations
巻	19巻
号	3号
出版者	Wiley
開始ページ	e70004
ISSN	1936-5209
NCID	AA1233231X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2025 CSIC and The Author(s).
論文のバージョン	publisher
DOI	10.1002/plr2.70004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1002/plr2.70004

Real‐World Data of Comprehensive Cancer Genomic Profiling Tests Performed in the Routine Clinical Setting in Sarcoma

フルテキストURL	fulltext.pdf suppl1.ppt suppl2.docx suppl3.docx suppl4.xlsx suppl5.docx suppl6.docx suppl7.docx suppl8.xlsx suppl9.docx suppl10.docx suppl11.docx suppl12.docx suppl13.docx suppl14.docx suppl15.docx suppl16.xlsx
著者	Nakata, Eiji\| Ennishi, Daisuke\| Osone, Tatsunori\| Ninomiya, Kiichiro\| Tomida, Shuta\| Itano, Takuto\| Fujiwara, Tomohiro\| Kunisada, Toshiyuki\| Ida, Naoyuki\| Yamamoto, Hideki\| Futagawa, Mashu\| Shimoi, Tatsunori\| Yanai, Hiroyuki\| Hirasawa, Akira\| Toyooka, Shinichi\| Tabata, Masahiro\| Ozaki, Toshifumi\|
キーワード	comprehensive genomic profiling genotype-matched therapy multiplex gene panel test sarcoma
発行日	2025-08
出版物タイトル	Cancer Medicine
巻	14巻
号	15号
出版者	Wiley
開始ページ	e71098
ISSN	2045-7634
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2025 The Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	40755265
DOI	10.1002/cam4.71098
Web of Science KeyUT	001543086300001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1002/cam4.71098

A low-cost dpMIG-seq method for elucidating complex inheritance in polysomic crops: a case study in tetraploid blueberry

フルテキストURL	fulltext.pdf suppl1.docx suppl2.docx
著者	Nagasaka, Kyoka\| Nishimura, Kazusa\| Motoki, Ko\| Yamagata, Keigo\| Nishiyama, Soichiro\| Yamane, Hisayo\| Tao, Ryutaro\| Nakano, Ryohei\| Nakazaki, Tetsuya\|
発行日	2024-09-04
出版物タイトル	Horticulture Research
巻	11巻
号	11号
出版者	Oxford University Press (OUP)
開始ページ	uhae248
ISSN	2052-7276
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2024.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	39539414
DOI	10.1093/hr/uhae248
Web of Science KeyUT	001354254400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1093/hr/uhae248

Genotypes and phenotypes of neurofibromatosis type 1 patients in Japan: A Hereditary Tumor Cohort Study

フルテキストURL	K0007232_abstract_review.pdf K0007232_fulltext.pdf K0007232_summary.pdf
著者	二川摩周\|
発行日	2025-03-25
資料タイプ	学位論文
学位授与番号	甲第7232号
学位授与年月日	2025-03-25
学位・専攻分野	博士（医学）
授与大学	岡山大学
言語	英語
著作権者	© The Author(s) 2024

Genotypes and phenotypes of neurofibromatosis type 1 patients in Japan: A Hereditary Tumor Cohort Study

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Futagawa, Mashu\| Okazaki, Tetsuya\| Nakata, Eiji\| Fukano, Chika\| Osumi, Risa\| Kato, Fumino\| Urakawa, Yusaku\| Yamamoto, Hideki\| Ozaki, Toshifumi\| Hirasawa, Akira\|
備考	The version of record of this article, first published in Human Genome Variation, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41439-024-00299-4\|
発行日	2024-11-26
出版物タイトル	Human Genome Variation
巻	11巻
号	1号
出版者	Springer Science and Business Media LLC
開始ページ	42
ISSN	2054-345X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2024
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	39592598
DOI	10.1038/s41439-024-00299-4
Web of Science KeyUT	001363412200001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41439-024-00299-4

Genome-Wide Association Study with Three Control Cohorts of Japanese Patients with Esotropia and Exotropia of Comitant Strabismus and Idiopathic Superior Oblique Muscle Palsy

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Matsuo, Toshihiko\| Hamasaki, Ichiro\| Kamatani, Yoichiro\| Kawaguchi, Takahisa\| Yamaguchi, Izumi\| Matsuda, Fumihiko\| Saito, Akira\| Nakazono, Kazuyuki\| Kamitsuji, Shigeo\|
キーワード	esotropia exotropia superior oblique muscle palsy genome-wide association study comitant strabismus non-comitant strabismus Japanese population BioBank Japan Nagahama Cohort Asian array
発行日	2024-06-26
出版物タイトル	International Journal of Molecular Sciences
巻	25巻
号	13号
出版者	MDPI
開始ページ	6986
ISSN	1422-0067
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 by the authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38809867
DOI	10.3390/ijms25136986
Web of Science KeyUT	001240951800006
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3390/ijms25136986

Isolation of Vibrio cholerae and Vibrio vulnificus from Estuarine Waters, and Genotyping of V. vulnificus Isolates Using Loop-Mediated Isothermal Amplification

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Miyoshi, Shin-Ichi\| Kurata, Megumi\| Hirose, Riho\| Yoshikawa, Masaya\| Liang, Yong\| Yamagishi, Yosuke\| Mizuno, Tamaki\|
キーワード	Vibrio cholerae Vibrio vulnificus genotype LAMP water temperature
発行日	2024-04-27
出版物タイトル	Microorganisms
巻	12巻
号	5号
出版者	MDPI
開始ページ	877
ISSN	2076-2607
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 by the authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38792707
DOI	10.3390/microorganisms12050877
Web of Science KeyUT	001231571500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3390/microorganisms12050877

The Genotypic and Phenotypic Characteristics Contributing to Flomoxef Sensitivity in Clinical Isolates of ESBL-Producing E.coli Strains from Urinary Tract Infections

フルテキストURL	K0006987_abstract_review.pdf K0006987_fulltext.pdf K0006987_summary.pdf
著者	榮枝一磨\|
発行日	2024-03-25
資料タイプ	学位論文
学位授与番号	甲第6987号
学位授与年月日	2024-03-25
学位・専攻分野	博士（医学）
授与大学	岡山大学
言語	英語
著作権者	© 2023 by the authors.

Experimental quantification of genetic and ontogenetic effects on fighting behavior in the broad-horned flour beetle

フルテキストURL	fulltext20240311-03.pdf
著者	Nishitani, Toshiki\| Matsumura, Kentarou\| Postma, Erik\| Sharma, Manmohan Dev\| Hosken, David J\| Miyatake, Takahisa\|
キーワード	Male-male contest Contest Aggressiveness Aging Genetics Beetle
備考	The version of record of this article, first published in Behavioral Ecology and Sociobiology, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1007/s00265-024-03451-w\|
発行日	2024-02-24
出版物タイトル	Behavioral Ecology and Sociobiology
巻	78巻
号	3号
出版者	Springer Science and Business Media LLC
開始ページ	34
ISSN	0340-5443
NCID	AA00558665
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2024
論文のバージョン	publisher
DOI	10.1007/s00265-024-03451-w
Web of Science KeyUT	001169750400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1007/s00265-024-03451-w

MCPtaggR: R package for accurate genotype calling in reduced representation sequencing data by eliminating error-prone markers based on genome comparison

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Furuta, Tomoyuki\| Yamamoto, Toshio\|
キーワード	genotyping genome comparison next-generation sequencing R package
発行日	2023-12-22
出版物タイトル	DNA Research
巻	31巻
号	1号
出版者	Oxford University Press
開始ページ	dsad027
ISSN	1340-2838
NCID	AA11095219
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38134958
DOI	10.1093/dnares/dsad027
Web of Science KeyUT	001155031000002
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1093/dnares/dsad027

Deep Learning Enables Instant and Versatile Estimation of Rice Yield Using Ground-Based RGB Images

フルテキストURL	fulltext20240109-02.pdf
著者	Tanaka, Yu\| Watanabe, Tomoya\| Katsura, Keisuke\| Tsujimoto, Yasuhiro\| Takai, Toshiyuki\| Tanaka, Takashi Sonam Tashi\| Kawamura, Kensuke\| Saito, Hiroki\| Homma, Koki\| Mairoua, Salifou Goube\| Ahouanton, Kokou\| Ibrahim, Ali\| Senthilkumar, Kalimuthu\| Semwal, Vimal Kumar\| Matute, Eduardo Jose Graterol\| Corredor, Edgar\| El-Namaky, Raafat\| Manigbas, Norvie\| Quilang, Eduardo Jimmy P.\| Iwahashi, Yu\| Nakajima, Kota\| Takeuchi, Eisuke\| Saito, Kazuki\|
発行日	2023-07-28
出版物タイトル	Plant Phenomics
巻	5巻
出版者	American Association for the Advancement of Science (AAAS)
開始ページ	0073
ISSN	2643-6515
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 Yu Tanaka et al.
論文のバージョン	publisher
DOI	10.34133/plantphenomics.0073
Web of Science KeyUT	001124487900004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.34133/plantphenomics.0073

Genetic basis of lineage-specific evolution of fruit traits in hexaploid persimmon

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Horiuchi, Ayano\| Masuda, Kanae\| Shirasawa, Kenta\| Onoue, Noriyuki\| Matsuzaki, Ryusuke\| Tao, Ryutaro\| Kubo, Yasutaka\| Ushijima, Koichiro\| Akagi, Takashi\|
キーワード	fruit shape astringency polyploid population structure GWAS
発行日	2023-06-16
出版物タイトル	DNA Research
巻	30巻
号	5号
出版者	Oxford University Press
開始ページ	dsad015
ISSN	1340-2838
NCID	AA11095219
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37326063
DOI	10.1093/dnares/dsad015
Web of Science KeyUT	001059198000001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1093/dnares/dsad015

GBScleanR: robust genotyping error correction using a hidden Markov model with error pattern recognition

フルテキストURL	fulltext20230828-01.pdf
著者	Furuta, Tomoyuki\| Yamamoto, Toshio\| Ashikari, Motoyuki\|
キーワード	reduced-representation sequencing error correction imputation hidden Markov model
発行日	2023-03-29
出版物タイトル	Genetics
巻	224巻
号	2号
出版者	Oxford University Press (OUP)
開始ページ	iyad055
ISSN	1943-2631
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36988327
DOI	10.1093/genetics/iyad055
Web of Science KeyUT	001029662300001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1093/genetics/iyad055

Elucidation of genetic variation and population structure of melon genetic resources in the NARO Genebank, and construction of the World Melon Core Collection

フルテキストURL	fulltext20230703-03.pdf
著者	Shigita, Gentaro\| Dung, Tran Phuong\| Pervin, Mst. Naznin\| Duong, Thanh-Thuy\| Imoh, Odirich Nnennaya\| Monden, Yuki\| Nishida, Hidetaka\| Tanaka, Katsunori\| Sugiyama, Mitsuhiro\| Kawazu, Yoichi\| Tomooka, Norihiko\| Kato, Kenji\|
キーワード	Cucumis melo Cucurbitaceae genotyping-by-sequencing genetic resource genetic diversity crop origin core collection
発行日	2023
出版物タイトル	Breeding Science
巻	73巻
号	3号
出版者	Japanese Society of Breeding
開始ページ	269
終了ページ	277
ISSN	1344-7610
NCID	AA11353132
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	2023 Japanese Society of Breeding.
論文のバージョン	publisher
DOI	10.1270/jsbbs.22071
Web of Science KeyUT	001011896500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1270/jsbbs.22071

Identification of genetic loci associated with renal dysfunction after lung transplantation using an ethnic-specific single-nucleotide polymorphism array

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Tomioka, Yasuaki\| Sugimoto, Seiichiro\| Yamamoto, Haruchika\| Tomida, Shuta\| Shiotani, Toshio\| Tanaka, Shin\| Shien, Kazuhiko\| Suzawa, Ken\| Miyoshi, Kentaroh\| Otani, Shinji\| Yamamoto, Hiromasa\| Okazaki, Mikio\| Yamane, Masaomi\| Toyooka, Shinichi\|
備考	The version of record of this article, first published in Scientific Reports, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-36143-y\|
発行日	2023-06-01
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	13巻
号	1号
出版者	nature portfolio
開始ページ	8912
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37264212
DOI	10.1038/s41598-023-36143-y
Web of Science KeyUT	001000430300041
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-023-36143-y

The Genotypic and Phenotypic Characteristics Contributing to Flomoxef Sensitivity in Clinical Isolates of ESBL-Producing E. coli Strains from Urinary Tract Infections

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Sakaeda, Kazuma\| Sadahira, Takuya\| Maruyama, Yuki\| Iwata, Takehiro\| Watanabe, Masami\| Wada, Koichiro\| Araki, Motoo\|
キーワード	antimicrobial resistance Escherichia coli urinary tract infections flomoxef ST131
発行日	2023-03-06
出版物タイトル	Antibiotics
巻	12巻
号	3号
出版者	MDPI
開始ページ	522
ISSN	2079-6382
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 by the authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36978389
DOI	10.3390/antibiotics12030522
Web of Science KeyUT	000952995400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3390/antibiotics12030522

Prevalence of Inducible Macrolide, Lincosamide, and Streptogramin B (inducible MLSB) Resistance in Clindamycin-Susceptible Staphylococcus aureus at Okayama University Hospital

JaLCDOI	10.18926/AMO/64355
フルテキストURL	77_1_1.pdf
著者	Nahar, Lutfun\| Hagiya, Hideharu\| Nada, Takahiro\| Iio, Koji\| Gotoh, Kazuyoshi\| Matsushita, Osamu\| Otsuka, Fumio\|
抄録	Inducible resistance to the macrolide, lincosamide, and streptogramin B (iMLSB) antibiotic family is a latent mechanism for antimicrobial resistance in Staphylococcus aureus. We here investigated the frequency and genotypic profiles of iMLSB resistance in clindamycin (CLDM)-susceptible S. aureus isolated in Okayama University Hospital from June 2020 to June 2021. We phenotypically screened the iMLSB resistance via D-zone test and performed PCR testing for the erythromycin ribosomal methylase (erm) genes: ermA and ermC. Among 432 CLDM-susceptible S. aureus isolates, 138 (31.9%) exhibited an iMLSB-resistance phenotype, with methicillinresistant S. aureus isolates (MRSA; 61 isolates: 58.6%) exhibiting higher positivity than methicillin-sensitive S. aureus isolates (MSSA; 77 isolates: 23.5%) (p<0.001). Male patients had a higher frequency of iMLSB resistance than females (OR [95%CI]: 1.8 [1.2-2.8]; p=0.007). Genotypically, ermA predominated in both MSSA (70.1%) and MRSA (86.9%) compared to ermC (14.3% in MSSA and 11.5% in MRSA). A single strain of MRSA possessed both ermA and ermC, while 12 (15.6%) MSSA isolates were negative for both ermA and ermC, suggesting the presence of other genetic mechanisms. Collectively, these results show that approximately 33% of CLDM-susceptible S. aureus isolates at our university hospital exhibited iMLSB resistance, predominantly caused by ermA in both MSSA and MRSA.
キーワード	antimicrobial resistance clindamycin erm D-zone test inducible MLSB
Amo Type	Original Article
出版物タイトル	Acta Medica Okayama
発行日	2023-02
巻	77巻
号	1号
出版者	Okayama University Medical School
開始ページ	1
終了ページ	9
ISSN	0386-300X
NCID	AA00508441
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
著作権者	Copyright Ⓒ 2023 by Okayama University Medical School
論文のバージョン	publisher
査読	有り
PubMed ID	36849140
Web of Science KeyUT	000953663800001