田村隆

Illumina-based transcriptomic analysis of the fast-growing leguminous tree Acacia crassicarpa: functional gene annotation and identification of novel SSR-markers

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Ishio, Shougo\| Kusunoki, Kazutaka\| Nemoto, Michiko\| Kanao, Tadayoshi\| Tamura, Takashi\|
キーワード	Acacia crassicarpa illumina sequencing polymorphism auxin response factor lignin
発行日	2024-08-29
出版物タイトル	Frontiers in Plant Science
巻	15巻
出版者	Frontiers Media
開始ページ	1339958
ISSN	1664-462X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 Ishio, Kusunoki, Nemoto, Kanao and Tamura.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	39268003
DOI	10.3389/fpls.2024.1339958
Web of Science KeyUT	001310352400001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3389/fpls.2024.1339958

Nuclear Transformation of the Marine Pennate Diatom Nitzschia sp. Strain NIES-4635 by Multi-Pulse Electroporation

著者	Okada, Koki\| Morimoto, Yu\| Shiraishi, Yukine\| Tamura, Takashi\| Mayama, Shigeki\| Kadono, Takashi\| Adachi, Masao\| Ifuku, Kentaro\| Nemoto, Michiko\|
キーワード	Diatom Genetic transformation Nitzschia Multi-pulse electroporation
備考	This version of the article has been accepted for publication, after peer review (when applicable) and is subject to Springer Nature’s AM terms of use, but is not the Version of Record and does not reflect post-acceptance improvements, or any corrections. The Version of Record is available online at: http://dx.doi.org/10.1007/s10126-023-10273-w\| This fulltext file will be available in Dec. 2024.\|
発行日	2023-12-10
出版物タイトル	Marine Biotechnology
巻	25巻
号	6号
出版者	Springer Science and Business Media LLC
開始ページ	1208
終了ページ	1219
ISSN	1436-2228
NCID	AA11357643
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s), under exclusive licence to Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature 2023
論文のバージョン	author
PubMed ID	38071657
DOI	10.1007/s10126-023-10273-w
Web of Science KeyUT	001120097200001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1007/s10126-023-10273-w

Structure and mechanism of oxalate transporter OxlT in an oxalate-degrading bacterium in the gut microbiota

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Jaunet-Lahary, Titouan\| Shimamura, Tatsuro\| Hayashi, Masahiro\| Nomura, Norimichi\| Hirasawa, Kouta\| Shimizu, Tetsuya\| Yamashita, Masao\| Tsutsumi, Naotaka\| Suehiro, Yuta\| Kojima, Keiichi\| Sudo, Yuki\| Tamura, Takashi\| Iwanari, Hiroko\| Hamakubo, Takao\| Iwata, So\| Okazaki, Kei-Ichi\| Hirai, Teruhisa\| Yamashita, Atsuko\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature Communications, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-36883-5\|
発行日	2023-04-03
出版物タイトル	Nature Communications
巻	14巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	1730
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37012268
DOI	10.1038/s41467-023-36883-5
Web of Science KeyUT	001002031500007
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-023-36883-5

Structural basis of enzyme activity regulation by the propeptide of l-lysine α-oxidase precursor from Trichoderma viride

フルテキストURL	fulltext20210530_4.pdf
著者	Kitagawa, Masaki\| Ito, Nanako\| Matsumoto, Yuya\| Saito, Masaya\| Tamura, Takashi\| Kusakabe, Hitoshi\| Inagaki, Kenji\| Imada, Katsumi\|
キーワード	L-Lysine α-oxidase Crystal structure Precursor Substrate recognition
発行日	2021-12-31
出版物タイトル	Journal of Structural Biology: X
巻	5巻
出版者	Elsevier
開始ページ	100044
ISSN	25901524
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2021 The Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33554108
DOI	10.1016/j.yjsbx.2021.100044
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2021.100044

Comparative Gene Analysis Focused on Silica Cell Wall Formation: Identification of Diatom-Specific SET Domain Protein Methyltransferases

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nemoto, Michiko\| Iwaki, Sayako\| Moriya, Hisao\| Monden, Yuki\| Tamura, Takashi\| Inagaki, Kenji\| Mayama, Shigeki\| Obuse, Kiori\|
キーワード	Biomineralization Diatom Silica Transcriptome Proteome
備考	This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in Marine Biotechnology. The final authenticated version is available online at: http://dx.doi.org/10.1007/s10126-020-09976-1.\|
発行日	2020-06-03
出版物タイトル	Marine Biotechnology
出版者	Springer
ISSN	1436-2228
NCID	AA11357643
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	フランス語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	32488507
DOI	10.1007/s10126-020-09976-1
Web of Science KeyUT	000537432000001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1007/s10126-020-09976-1

Marinomonas mediterranea由来キノン含有新規グリシンオキシダーゼの大腸菌発現系の確立と性質検討

タイトル（別表記）	Recombinant expression and characterization of quinone-containing novel glycine oxidase from Marinomonas mediterranea
フルテキストURL	srfa_109_001_006.pdf
著者	梶山雄輝\| 溝端佐津紀\| 赤地周作\| 根本理子\| 田村隆\| 稲垣賢二\|
抄録	Novel glycine oxidase (GlyOX) from Marinomonas mediterranea depends on cysteine tryptophilquinone (CTQ) and catalyzes the oxidative deamination of glycine to produce a glyoxylate, ammonia, and hydrogen peroxide. M. mediterranea GlyOX genes (goxA and goxB) were cloned and recombinant GlyOX was heterologously expressed by E. coli. The purification of recombinant GlyOX was carried out by metal affinity and DEAE-Toyopearl 650M column chromatographies. M. mediterranea GlyOX was homotetramic with a molecular mass of 76kDa and showed optimum activity around 30°C and at pH 5.0, and stability below 50°C and between pH 5.0 to 9.0. M. mediterranea GlyOX shows a strict substrate specificity toward glycine, and the Michaelis constant for glycine was 0.5mM. M. mediterranea GlyOX could determine the quantity of glycine in human serum and human blood plasma with high sensitivity. This study revealed the catalytic and structural properties of M. mediterranea GlyOX with high substrate specificity.
キーワード	glycine oxidase Marinomonas mediterranea cysteine tryptophilquinone recombinant expression enzymatic glycine assay
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
発行日	2020-02-01
巻	109巻
開始ページ	1
終了ページ	6
ISSN	2186-7755
言語	日本語
論文のバージョン	publisher

大学生の朝食欠食習慣の統計解析と改善への新指針

著者	田村隆\| 揖斐隆之\| 稲垣賢二\| 久保康隆\| 奥田潔\|
発行日	2016-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	105巻
資料タイプ	紀要論文

Molecular evolution of gas cavity in [NiFeSe] hydrogenases resurrected in silico

著者	Tamura, Takashi\| Tsunekawa, Naoki\| Nemoto, Michiko\| Inagaki, Kenji\| Hirano, Toshiyuki\| Sato, Fumitoshi\|
発行日	2016-01-28
出版物タイトル	Scientific reports
巻	6巻
資料タイプ	学術雑誌論文

Draft Genome Sequence of Streptomyces incarnatus NRRL8089, which Produces the Nucleoside Antibiotic Sinefungin

著者	Oshima, Kenshiro\| Hattori, Masahira\| Shimizu, Hitomi\| Fukuda, Koji\| Nemoto, Michiko\| Inagaki, Kenji\| Tamura, Takashi\|
発行日	2015-07-09
出版物タイトル	Genome Announcements
巻	3巻
号	4号
資料タイプ	学術雑誌論文

高基質特異性L-グルタミン酸オキシダーゼより作成した基質特異性改変酵素L-アルギニンオキシダーゼの性質検討

著者	中井隆一郎\| 藤野志保子\| 内海友宏\| 田村隆\| 日下部均\| 稲垣賢二\|
発行日	2014-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	103巻
資料タイプ	紀要論文

好熱性細菌Thermus sp.O-3-1由来耐熱性アミダーゼの精製及び性質検討

著者	小林史明\| 青峰弘起\| 水無渉\| 湯不二夫\| 田村隆\| 稲垣賢二\|
発行日	2012-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	101巻
資料タイプ	紀要論文

放線菌Streptomyces sp.590由来l-メチオニン脱炭酸酵素の精製および性質検討

著者	前村知美\| 内富久美子\| 日下知香\| 稲垣純子\| 田村隆\| 左右田健次\| 稲垣賢二\|
発行日	2011-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	100巻
資料タイプ	紀要論文

Selenite Assimilation into Formate Dehydrogenase H Depends on Thioredoxin Reductase in Escherichia coli

著者	Takahata, Muneaki\| Tamura, Takashi\| Abe, Katsumasa\| Mihara, Hisaaki\| Kurokawa, Suguru\| Yamamoto, Yoshihiro\| Nakano, Ryuhei\| Esaki, Nobuyoshi\| Inagaki, Kenji\|
発行日	2008-06-26
出版物タイトル	Journal of Biochemistry
巻	143巻
号	4号
資料タイプ	学術雑誌論文

好熱好酸性アーキア Sulfolobus tokodaii 由来シスタチオニン γ-シンターゼの精製及び性質検討

著者	篠崎舞\| 柳谷昌彦\| 兼田翔一郎\| 工藤大蔵\| 遠藤祐一\| 田村隆\| 倉光成紀\| 稲垣賢二\|
発行日	2010-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	99巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

シネフンギン生産菌Streptomyces incarnatus NRRL 8089由来アルギニン変換化合物「オルニチンラクタム」の同定

著者	福田康二\| 田村隆\| 稲垣賢二\|
発行日	2010-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	99巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

高度好熱性細菌 Thermus thermophilus HB8 由来アラニンラセマーゼの大腸菌での発現，精製及び諸性質の検討

著者	柳谷昌彦\| 上前智\| 白神智行\| 田村隆\| 稲垣賢二\|
発行日	2009-02
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	98巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

海産性好熱性細菌 Rhodothermus marinus 由来イソアミラーゼの精製，性質検討及びＸ線結晶構造解析

著者	立花亜紀子\| 田村隆\| 今田勝巳\| 木下実紀\| 難波啓一\| 堤紀子\| 橋田みよ子\| 坂口博脩\| 稲垣賢二\|
発行日	2008-02
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	97巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

セレノシステイン含有ペプチドの合成と生化学的機能の研究

著者	田村隆\|
発行日	1995-02-01
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	84巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

Alanine Racemase from an Acidophilic Bacterium, Acidiphilium organovorum

著者	スィアオテッキョン\| 稲垣賢二\| 田村隆\| 田中英彦\|
発行日	1997-02
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	86巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

Pseudomonas putida のＬ－メチオニン分解系オペロンの解析

著者	井上浩之\| 田村隆\| 稲垣賢二\| 田中英彦\|
発行日	1998-02
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
巻	87巻
号	1号
資料タイプ	紀要論文

田村 隆