フルテキストURL fulltext.pdf suppl.docx
著者 Oo, May Wathone| Hikita, Takao| Mashima, Tomoha| Torigata, Kosuke| Thu, Yin Min| Habu, Tomohiro| Kawai, Hotaka| Ohara, Toshiaki| Tomida, Shuta| Ito, Sachio| Suzawa, Ken| Nagatsuka, Hitoshi| Toyooka, Shinichi| Nakayama, Masanori|
キーワード Cancer-associated fibroblast Superoxide dismutase 3 Lymphangiogenesis Angiogenesis Metastasis Lung adenocarcinoma
備考 The version of record of this article, first published in Angiogenesis, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1007/s10456-025-10005-9|
発行日 2025-09-30
出版物タイトル Angiogenesis
28巻
4号
出版者 Springer Science and Business Media LLC
開始ページ 51
ISSN 1573-7209
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © The Author(s) 2025
論文のバージョン publisher
PubMed ID 41028519
DOI 10.1007/s10456-025-10005-9
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1007/s10456-025-10005-9
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Maki, Yoshie| Kono, Yoshiyasu| Ozato, Toshiki| Yamamoto, Hideki| Hirasawa, Akira| Ennishi, Daisuke| Tomida, Shuta| Toyooka, Shinichi| Hamada, Kenta| Iwamuro, Masaya| Kawano, Seiji| Otsuka, Motoyuki|
キーワード Homologous recombination repair gene Early-onset gastric cancer Comprehensive genomic profiling
備考 The version of record of this article, first published in Journal of Gastroenterology, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1007/s00535-025-02267-3|
発行日 2025-06-13
出版物タイトル Journal of Gastroenterology
出版者 Springer Science and Business Media LLC
ISSN 0944-1174
NCID AA10988015
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © The Author(s) 2025
論文のバージョン publisher
PubMed ID 40514520
DOI 10.1007/s00535-025-02267-3
Web of Science KeyUT 001507782700001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1007/s00535-025-02267-3
フルテキストURL fulltext.pdf suppl1.pdf suppl2.xlsx suppl3.pdf suppl4.pdf suppl5.xlsx
著者 Soh, Junichi| Yamamoto, Hiromasa| Okumura, Norihito| Suzuki, Hiroyuki| Nakata, Masao| Fujiwara, Toshiya| Gemba, Kenicehi| Sano, Isao| Fujinaga, Takuji| Kataoka, Masafumi| Terasaki, Yasuhiro| Fujimoto, Nobukazu| Kataoka, Kazuhiko| Kosaka, Shinji| Yamashita, Motohiro| Inokawa, Hidetoshi| Inoue, Masaaki| Nakamura, Hiroshige| Yamashita, Yoshinori| Takahashi, Yuta| Torigoe, Hidejiro| Sato, Hiroki| Tomida, Shuta| Hotta, Katsuyuki| Yoshioka, Hiroshige| Morita, Satoshi| Matsuo, Keitaro| Sakamoto, Junichi| Date, Hiroshi| Toyooka, Shinichi|
キーワード non‑small cell lung cancer elderly patients adjuvant chemotherapy S‑1 EGFR TP TS OPRT ERCC1 DPD
発行日 2025-07-03
出版物タイトル Molecular and Clinical Oncology
23巻
3号
出版者 Spandidos Publications
開始ページ 79
ISSN 2049-9450
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © Soh et al.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 40692744
DOI 10.3892/mco.2025.2874
Web of Science KeyUT 001532725400001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.3892/mco.2025.2874
著者 Ozato, Toshiki| Kono, Yoshiyasu| Horiguchi, Shigeru| Tsutsumi, Koichiro| Yamamoto, Hideki| Hirasawa, Akira| Ennishi, Daisuke| Tomida, Shuta| Toyooka, Shinichi| Otsuka, Motoyuki|
キーワード Homologous recombination repair Small bowel adenocarcinoma Genome
備考 © 2025 Elsevier Ltd. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 license https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/| This fulltext file will be available in Apr. 2026.|
発行日 2025-05-02
出版物タイトル European Journal of Cancer
220巻
出版者 Elsevier BV
開始ページ 115401
ISSN 0959-8049
NCID AA1075407X
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2025 Elsevier Ltd.
論文のバージョン author
PubMed ID 40188744
DOI 10.1016/j.ejca.2025.115401
Web of Science KeyUT 001465491700001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.ejca.2025.115401
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Kamio, Tomohiro| Kono, Yoshiyasu| Hirosuna, Kensuke| Ozato, Toshiki| Yamamoto, Hideki| Hirasawa, Akira| Ennishi, Daisuke| Tomida, Shuta| Toyooka, Shinichi| Otsuka, Motoyuki|
キーワード comprehensive genomic profiling early-onset gastric cancer oxaliplatin TP53
発行日 2025-04-18
出版物タイトル Cancer Medicine
14巻
8号
出版者 Wiley
開始ページ e70793
ISSN 2045-7634
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2025 The Author(s).
論文のバージョン publisher
PubMed ID 40249206
DOI 10.1002/cam4.70793
Web of Science KeyUT 001469550900001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1002/cam4.70793
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Nishikori, Asami| Nishimura, Midori Filiz| Tomida, Shuta| Chijimatsu, Ryota| Ueta, Himawari| Lai, You Cheng| Kawahara, Yuri| Takeda, Yudai| Ochi, Sayaka| Haratake, Tomoka| Ennishi, Daisuke| Nakamura, Naoya| Momose, Shuji| Sato, Yasuharu|
キーワード idiopathic multicentric Castleman disease cytokine storm transcriptome analysis
発行日 2024
出版物タイトル Journal of Clinical and Experimental Hematopathology
64巻
4号
出版者 Japanese Society for Lymphoreticular Tissue Research
開始ページ 297
終了ページ 306
ISSN 1346-4280
NCID AA11556796
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2024 The Japanese Society for Lymphoreticular Tissue Research
論文のバージョン publisher
PubMed ID 39462545
DOI 10.3960/jslrt.24061
Web of Science KeyUT 001344315800001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.3960/jslrt.24061
フルテキストURL fulltext20241015-01.pdf fig20241015-01.pdf
著者 Ninomiya, Kiichiro| Ennishi, Daisuke| Okamoto, Kunio| Ando, Midori| Nakamura, Satoko| Tomida, Shuta| Ayada, Yoshiyuki| Makimoto, Go| Ichihara, Eiki| Okita, Natsuko| Toyooka, Shinichi| Maeda, Yoshinobu| Tabata, Masahiro|
備考 This is an Accepted Manuscript of an article published by American Society of Clinical Oncology (ASCO).| This fulltext file will be available in Sep. 2025.|
発行日 2024-09-19
出版物タイトル JCO Precision Oncology
8巻
出版者 American Society of Clinical Oncology (ASCO)
開始ページ e2400228
ISSN 2473-4284
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2024 by American Society of Clinical Oncology.
論文のバージョン author
PubMed ID 39298692
DOI 10.1200/po.24.00228
Web of Science KeyUT 001328214400001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1200/po.24.00228
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Thu, Yin Min| Suzawa, Ken| Tomida, Shuta| Ochi, Kosuke| Tsudaka, Shimpei| Takatsu, Fumiaki| Date, Keiichi| Matsuda, Naoki| Iwata, Kazuma| Nakata, Kentaro| Shien, Kazuhiko| Yamamoto, Hiromasa| Okazaki, Mikio| Sugimoto, Seiichiro| Toyooka, Shinichi|
発行日 2024-05-17
出版物タイトル PLoS ONE
19巻
5号
出版者 Public Library of Science
開始ページ e0300644
ISSN 1932-6203
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2024 Thu et al.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 38758826
DOI 10.1371/journal.pone.0300644
Web of Science KeyUT 001227109100078
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1371/journal.pone.0300644
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Sasakura, Minori| Urakami, Hitoshi| Tachibana, Kota| Ikeda, Kenta| Hasui, Ken-Ichi| Matsuda, Yoshihiro| Sunagawa, Ko| Ennishi, Daisuke| Tomida, Shuta| Morizane, Shin|
キーワード AP-1 inhibitor Atopic dermatitis Baricitinib T-5224 Topical application
発行日 2024-04
出版物タイトル Allergology International
73巻
2号
出版者 Japanese Society of Allergology
開始ページ 323
終了ページ 331
ISSN 1323-8930
NCID AA11091750
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2024 Japanese Society of Allergology.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 38350816
DOI 10.1016/j.alit.2023.12.006
Web of Science KeyUT 001220243500001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.alit.2023.12.006
フルテキストURL fulltext20240213-01.pdf
著者 Urata, Tomohiro| Naoi, Yusuke| Jiang, Aixiang| Boyle, Merrill| Sunami, Kazutaka| Imai, Toshi| Nawa, Yuichiro| Hiramatsu, Yasushi| Yamamoto, Kazuhiko| Fujii, Soichiro| Yoshida, Isao| Yano, Tomofumi| Chijimatsu, Ryota| Murakami, Hiroyuki| Ikeuchi, Kazuhiro| Kobayashi, Hiroki| Tani, Katsuma| Ujiie, Hideki| Inoue, Hirofumi| Tomida, Shuta| Yamamoto, Akira| Kondo, Takumi| Fujiwara, Hideaki| Asada, Noboru| Nishimori, Hisakazu| Fujii, Keiko| Fujii, Nobuharu| Matsuoka, Ken-ichi| Sawada, Keisuke| Momose, Shuji| Tamaru, Jun-ichi| Nishikori, Asami| Sato, Yasuharu| Yoshino, Tadashi| Maeda, Yoshinobu| Scott, David W.| Ennishi, Daisuke|
発行日 2023-12-14
出版物タイトル Blood Advances
7巻
24号
出版者 American Society of Hematology
開始ページ 7459
終了ページ 7470
ISSN 2473-9529
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2023 by The American Society of Hematology.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 37552496
DOI 10.1182/bloodadvances.2023010402
Web of Science KeyUT 001141306600001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1182/bloodadvances.2023010402
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Tomioka, Yasuaki| Sugimoto, Seiichiro| Yamamoto, Haruchika| Tomida, Shuta| Shiotani, Toshio| Tanaka, Shin| Shien, Kazuhiko| Suzawa, Ken| Miyoshi, Kentaroh| Otani, Shinji| Yamamoto, Hiromasa| Okazaki, Mikio| Yamane, Masaomi| Toyooka, Shinichi|
備考 The version of record of this article, first published in Scientific Reports, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-36143-y|
発行日 2023-06-01
出版物タイトル Scientific Reports
13巻
1号
出版者 nature portfolio
開始ページ 8912
ISSN 2045-2322
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © The Author(s) 2023
論文のバージョン publisher
PubMed ID 37264212
DOI 10.1038/s41598-023-36143-y
Web of Science KeyUT 001000430300041
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-023-36143-y
JaLCDOI 10.18926/AMO/65502
フルテキストURL 77_3_323.pdf
著者 Makino, Keigo| Otani, Yoshihiro| Fujii, Kentaro| Ishida, Joji| Hirano, Shuichiro | Suruga, Yasuki| Washio, Kana| Nishida, Kenji| Yanai, Hiroyuki| Tomida, Shuta| Ennishi, Daisuke| Date, Isao|
抄録 In the current World Health Organization classification of central nervous system tumors, comprehensive genetic and epigenetic analyses are considered essential for precise diagnosis. A 14-year-old male patient who presented with a cerebellar tumor was initially diagnosed with glioblastoma and treated with radiation and concomitant temozolomide chemotherapy after resection. During maintenance temozolomide therapy, a new contrast-enhanced lesion developed in the bottom of the cavity formed by the resection. A second surgery was performed, but the histological findings in specimens from the second surgery were different from those of the first surgery. Although genome-wide DNA methylation profiling was conducted using frozen tissue for a precise diagnosis, the proportion of tumor cells was insufficient and only normal cerebellum was observed. We then performed comprehensive genetic analysis using formalin-fixed paraffin-embedded sections, which revealed MYCN amplification without alteration of IDH1, IDH2, or Histone H3. Finally, the patient was diagnosed with pediatric-type diffuse high-grade glioma, H3-wildtype and IDH-wildtype. In conclusion, comprehensive genetic and epigenetic analysis should be considered in pediatric brain tumor cases.
キーワード comprehensive genomic profiling pediatric brain tumor genome-wide DNA methylation MYCN
Amo Type Case Report
出版物タイトル Acta Medica Okayama
発行日 2023-06
77巻
3号
出版者 Okayama University Medical School
開始ページ 323
終了ページ 330
ISSN 0386-300X
NCID AA00508441
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
著作権者 Copyright Ⓒ 2023 by Okayama University Medical School
論文のバージョン publisher
査読 有り
PubMed ID 37357634
Web of Science KeyUT 001025850000001
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Sekito, Takanori| Wada, Koichiro| Ishii, Ayano| Iwata, Takehiro| Matsubara, Takehiro| Tomida, Shuta| Watanabe, Masami| Araki, Motoo| Sadahira, Takuya|
キーワード cystitis vagina microbiota Lactobacillus urinary tract infection
発行日 2023-05-18
出版物タイトル Frontiers in Microbiology
14巻
出版者 Frontiers Media
開始ページ 1187479
ISSN 1664-302X
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2023 Sekito, Wada, Ishii, Iwata, Matsubara, Tomida, Watanabe, Araki and Sadahira.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 37275169
DOI 10.3389/fmicb.2023.1187479
Web of Science KeyUT 000998008400001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1187479
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Ochi, Kosuke| Suzawa, Ken| Thu, Yin Min| Takatsu, Fumiaki| Tsudaka, Shimpei| Zhu, Yidan| Nakata, Kentaro| Takeda, Tatsuaki| Shien, Kazuhiko| Yamamoto, Hiromasa| Okazaki, Mikio| Sugimoto, Seiichiro| Shien, Tadahiko| Okamoto, Yoshiharu| Tomida, Shuta| Toyooka, Shinichi|
キーワード cancer-associated fibroblast drug resistance tranilast
発行日 2022-07-24
出版物タイトル Cancer Science
2022巻
出版者 Wiley
ISSN 1347-9032
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2022 The Authors.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 35871750
DOI 10.1111/cas.15502
Web of Science KeyUT 000840374000001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1111/cas.15502
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Namba, Kei| Suzawa, Ken| Shien, Kazuhiko| Miura, Akihiro| Takahashi, Yuta| Miyauchi, Shunsaku| Araki, Kota| Nakata, Kentaro| Tomida, Shuta| Tanaka, Shin| Miyoshi, Kentaroh| Otani, Shinji| Yamamoto, Hiromasa| Okazaki, Mikio| Sugimoto, Seiichiro| Soh, Junichi| Yamane, Masaomi| Toyooka, Shinichi|
発行日 2022-05-04
出版物タイトル Scientific Reports
12巻
1号
出版者 Nature Portfolio
開始ページ 7297
ISSN 2045-2322
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © The Author(s) 2022
論文のバージョン publisher
PubMed ID 35508484
DOI 10.1038/s41598-022-11064-4
Web of Science KeyUT 000790941900040
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-022-11064-4
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Higo, Hisao| Ohashi, Kadoaki| Tomida, Shuta| Okawa, Sachi| Yamamoto, Hiromasa| Sugimoto, Seiichiro| Senoo, Satoru| Makimoto, Go| Ninomiya, Kiichiro| Nakasuka, Takamasa| Nishii, Kazuya| Taniguchi, Akihiko| Kubo, Toshio| Ichihara, Eiki| Hotta, Katsuyuki| Miyahara, Nobuaki| Maeda, Yoshinobu| Toyooka, Shinichi| Kiura, Katsuyuki|
キーワード Idiopathic pulmonary fibrosis RNA sequencing Molecular therapeutic target Personalized therapy
発行日 2022-02-07
出版物タイトル Respiratory Research
23巻
1号
出版者 BMC
開始ページ 20
ISSN 1465-993X
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © The Author(s) 2022.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 35130915
DOI 10.1186/s12931-022-01940-y
Web of Science KeyUT 000752386100002
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1186/s12931-022-01940-y
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Oo, May Wathone| Kawai, Hotaka| Takabatake, Kiyofumi| Tomida, Shuta| Eguchi, Takanori| Ono, Kisho| Shan, Qiusheng| Ohara, Toshiaki| Yoshida, Saori| Omori, Haruka| Sukegawa, Shintaro| Nakano, Keisuke| Okamoto, Kuniaki| Sasaki, Akira| Nagatsuka, Hitoshi|
発行日 2022-01-11
出版物タイトル JCI Insight
7巻
1号
出版者 American Society for Clinical Investigation
開始ページ e148960
ISSN 2379-3708
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © 2022, Oo et al.
論文のバージョン publisher
PubMed ID 34874922
DOI 10.1172/jci.insight.148960
Web of Science KeyUT 000743257400001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1172/jci.insight.148960
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Nakamura, Makoto| Meguri, Yusuke| Ikegawa, Shuntaro| Kondo, Takumi| Sumii, Yuichi| Fukumi, Takuya| Iwamoto, Miki| Sando, Yasuhisa| Sugiura, Hiroyuki| Asada, Noboru| Ennishi, Daisuke| Tomida, Shuta| Fukuda-Kawaguchi, Emi| Ishii, Yasuyuki| Maeda, Yoshinobu| Matsuoka, Ken-Ichi|
発行日 2021-06-23
出版物タイトル Scientific Reports
11巻
1号
出版者 Nature Research
開始ページ 13125
ISSN 2045-2322
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 © The Author(s) 2021
論文のバージョン publisher
PubMed ID 34162921
DOI 10.1038/s41598-021-92526-z
Web of Science KeyUT 000669995600012
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-021-92526-z
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 Inoue, Hirofumi| Tomida, Shuta| Horiguchi, Shigeru| Kato, Hironari| Matsuoka, Hiromi| Sanehira, Etsuko| Matsuoka, Masashi| Yanai, Hiroyuki| Hirasawa, Akira| Toyooka, Shinichi|
キーワード cancer genomic profiling tests formalin‐fixed paraffin‐embedded (FFPE) tumor tissue genomic DNA extraction
備考 This is the peer reviewed version of the following article: Hirofumi Inoue et. al. Best practices for the extraction of genomic DNA from formalin‐fixed paraffin‐embedded tumor tissue for cancer genomic profiling tests. Pathology International (2021), which has been published in final form at https://doi.org/10.1111/pin.13086. This article may be used for non-commercial purposes in accordance with Wiley Terms and Conditions for Use of Self-Archived Versions.
This fulltext is available in March 2022.|
発行日 2021-03-03
出版物タイトル Pathology International
71巻
出版者 Wiley
開始ページ 360
終了ページ 364
ISSN 1320-5463
NCID AA10984364
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 英語
OAI-PMH Set 岡山大学
論文のバージョン author
PubMed ID 33657250
DOI 10.1111/pin.13086
Web of Science KeyUT 000624843200001
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1111/pin.13086
JaLCDOI Training Medical Staff with Basic Skills for Data Science in Genomic Medicine
フルテキストURL fulltext.pdf
著者 冨田 秀太| 森田 瑞樹| 山下 範之| 平沢 晃| 豊岡 伸一|
キーワード genomic medicine tumor mutation burden biomedical data science bioinformatics
発行日 2020-05-01
出版物タイトル YAKUGAKU ZASSHI
140巻
5号
出版者 日本薬学会
開始ページ 657
終了ページ 661
ISSN 0031-6903
NCID AN00284903
資料タイプ 学術雑誌論文
言語 日本語
OAI-PMH Set 岡山大学
著作権者 日本薬学会
論文のバージョン publisher
PubMed ID 32378667
DOI 10.1248/yakushi.19-00217-2
Web of Science KeyUT 000596822500010
関連URL isVersionOf https://doi.org/10.1248/yakushi.19-00217-2