須藤雄気

Bidirectional Optical Control of Proton Motive Force in Escherichia coli Using Microbial Rhodopsins

著者	Nakanishi, Kotaro\| Kojima, Keiichi\| Sowa, Yoshiyuki\| Sudo, Yuki\|
備考	This document is the Accepted Manuscript version of a Published Work that appeared in final form in Journal of Physical Chemistry B, copyright © 2024 American Chemical Society after peer review and technical editing by the publisher. To access the final edited and published work see https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c03027.\| This fulltext file will be available in Aug. 2025.\|
発行日	2024-07-01
出版物タイトル	The Journal of Physical Chemistry B
巻	128巻
号	27号
出版者	American Chemical Society (ACS)
開始ページ	6509
終了ページ	6517
ISSN	1520-6106
NCID	AA11114073
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2024 American Chemical Society
論文のバージョン	author
PubMed ID	38949422
DOI	10.1021/acs.jpcb.4c03027
Web of Science KeyUT	001261316100001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.4c03027

Large-volume focus control at 10 MHz refresh rate via fast line-scanning amplitude-encoded scattering-assisted holography

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Shibukawa, Atsushi\| Higuchi, Ryota\| Song, Gookho\| Mikami, Hideharu\| Sudo, Yuki\| Jang, Mooseok\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature Communications, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-47009-w\|
発行日	2024-04-08
出版物タイトル	Nature Communications
巻	15巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	2926
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2024
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	38589389
DOI	10.1038/s41467-024-47009-w
Web of Science KeyUT	001198902100006
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-024-47009-w

Identification of a Functionally Efficient and Thermally Stable Outward Sodium-Pumping Rhodopsin (BeNaR) from a Thermophilic Bacterium

フルテキストURL	fulltext20231011-03.pdf
著者	Kurihara, Marie\| Thiel, Vera\| Takahashi, Hirona\| Kojima, Keiichi\| Ward, David M.\| Bryant, Donald A.\| Sakai, Makoto\| Yoshizawa, Susumu\| Sudo, Yuki\|
キーワード	rhodopsin ion transport retinal isomerization optogenetics
発行日	2023-02-01
出版物タイトル	Chemical and Pharmaceutical Bulletin
巻	71巻
号	2号
出版者	Pharmaceutical Society of Japan
開始ページ	154
終了ページ	164
ISSN	0009-2363
NCID	AA00602100
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Pharmaceutical Society of Japan
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36724978
DOI	10.1248/cpb.c22-00774
Web of Science KeyUT	000964953300013
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1248/cpb.c22-00774

Expression of microbial rhodopsins in Escherichia coli and their extraction and purification using styrene-maleic acid copolymers

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Sudo, Yuki\|
発行日	2022-03-18
出版物タイトル	STAR Protocols
巻	3巻
号	1号
出版者	Cell Press
開始ページ	101046
ISSN	2666-1667
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2021
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	34984357
DOI	10.1016/j.xpro.2021.101046
Web of Science KeyUT	001055085700004
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.xpro.2021.101046

Demonstration of iodide-dependent UVA-triggered growth inhibition in Saccharomyces cerevisiae cells and identification of its suppressive molecules

フルテキストURL	fulltext20230828-02.pdf
著者	Ono, Ryota\| Saeki, Nozomu\| Kojima, Keiichi\| Moriya, Hisao\| Sudo, Yuki\|
キーワード	UVA Saccharomyces cerevisiae Iodide Growth inhibition Suppressive molecule
備考	© 2023 Elsevier Inc. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 license https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/\| This fulltext file will be available in Oct. 2024.\|
発行日	2023-10-15
出版物タイトル	Biochemical and Biophysical Research Communications
巻	677巻
出版者	Elsevier BV
開始ページ	1
終了ページ	5
ISSN	0006-291X
NCID	AA00564395
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 Elsevier Inc.
論文のバージョン	author
PubMed ID	37523893
DOI	10.1016/j.bbrc.2023.07.048
Web of Science KeyUT	001047346900001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2023.07.048

Structure and mechanism of oxalate transporter OxlT in an oxalate-degrading bacterium in the gut microbiota

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Jaunet-Lahary, Titouan\| Shimamura, Tatsuro\| Hayashi, Masahiro\| Nomura, Norimichi\| Hirasawa, Kouta\| Shimizu, Tetsuya\| Yamashita, Masao\| Tsutsumi, Naotaka\| Suehiro, Yuta\| Kojima, Keiichi\| Sudo, Yuki\| Tamura, Takashi\| Iwanari, Hiroko\| Hamakubo, Takao\| Iwata, So\| Okazaki, Kei-Ichi\| Hirai, Teruhisa\| Yamashita, Atsuko\|
備考	The version of record of this article, first published in Nature Communications, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41467-023-36883-5\|
発行日	2023-04-03
出版物タイトル	Nature Communications
巻	14巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	1730
ISSN	2041-1723
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37012268
DOI	10.1038/s41467-023-36883-5
Web of Science KeyUT	001002031500007
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41467-023-36883-5

A blue-shifted anion channelrhodopsin from the Colpodellida alga Vitrella brassicaformis

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Kawanishi, Shiho\| Nishimura, Yosuke\| Hasegawa, Masumi\| Nakao, Shin\| Nagata, Yuya\| Yoshizawa, Susumu\| Sudo, Yuki\|
備考	The version of record of this article, first published in Scientific Reports, is available online at Publisher’s website: http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-34125-8\|
発行日	2023-04-28
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	13巻
号	1号
出版者	nature portfolio
開始ページ	6974
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37117398
DOI	10.1038/s41598-023-34125-8
Web of Science KeyUT	000985908500047
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-023-34125-8

Development of light-induced disruptive liposomes (LiDL) as a photoswitchable carrier for intracellular substance delivery

フルテキストURL	fulltext20230619-04.pdf
著者	Tsuneishi, Taichi\| Kojima, Keiichi\| Kubota, Fumika\| Harashima, Hideyoshi\| Yamada, Yuma\| Sudo, Yuki\|
発行日	2023
出版物タイトル	Chemical Communications
巻	59巻
号	49号
出版者	Royal Society of Chemistry (RSC)
開始ページ	7591
終了ページ	7594
ISSN	1359-7345
NCID	AA11071130
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Royal Society of Chemistry 2023
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37254694
DOI	10.1039/d3cc02056h
Web of Science KeyUT	000999015900001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/D3CC02056H

Correction: Convergent evolution of animal and microbial rhodopsins

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Sudo, Yuki\|
発行日	2023-03-06
出版物タイトル	RSC Advances
巻	13巻
号	11号
出版者	Royal Society of Chemistry
開始ページ	7222
終了ページ	7224
ISSN	2046-2069
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36891494
DOI	10.1039/d3ra90016a
Web of Science KeyUT	000943987600001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/d3ra90016a

Convergent evolution of animal and microbial rhodopsins

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Sudo, Yuki\|
発行日	2023-02-13
出版物タイトル	RSC Advances
巻	13巻
号	8号
出版者	ROYAL SOC CHEMISTRY
開始ページ	5367
終了ページ	5381
ISSN	2046-2069
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Author(s).
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36793294
DOI	10.1039/d2ra07073a
Web of Science KeyUT	000929858500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1039/d2ra07073a

Detection of Membrane Potential-Dependent Rhodopsin Fluorescence Using Low-Intensity Light Emitting Diode for Long-Term Imaging

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kawanishi, Shiho\| Kojima, Keiichi\| Shibukawa, Atsushi\| Sakamoto, Masayuki\| Sudo, Yuki\|
発行日	2023-01-25
出版物タイトル	ACS Omega
巻	8巻
出版者	American Chemical Society
開始ページ	4826
終了ページ	4834
ISSN	2470-1343
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 The Authors.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	36777568
DOI	10.1021/acsomega.2c06980
Web of Science KeyUT	000926216100001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acsomega.2c06980

Exploring the Retinal Binding Cavity of Archaerhodopsin-3 by Replacing the Retinal Chromophore With a Dimethyl Phenylated Derivative

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Tsuneishi, Taichi\| Takahashi, Masataka\| Tsujimura, Masaki\| Kojima, Keiichi\| Ishikita, Hiroshi\| Takeuchi, Yasuo\| Sudo, Yuki\|
キーワード	retinal rhodopsin proton pump derivative photoreceptor
発行日	2021-12-20
出版物タイトル	Frontiers In Molecular Biosciences
巻	8巻
出版者	Frontiers Media SA
開始ページ	794948
ISSN	2296-889X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2021 Tsuneishi, Takahashi, Tsujimura, Kojima, Ishikita, Takeuchi and Sudo.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	34988122
DOI	10.3389/fmolb.2021.794948
Web of Science KeyUT	000738864800001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.794948

Proton transfer pathway in anion channelrhodopsin-1

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Tsujimura, Masaki\| Kojima, Keiichi\| Kawanishi, Shiho\| Sudo, Yuki\| Ishikita, Hiroshi\|
発行日	2021-12-21
出版物タイトル	Elife
巻	10巻
出版者	eLIFE SCIENCES PUBL LTD
開始ページ	e72264
ISSN	2050-084X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© Tsujimura et al.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	34930528
DOI	10.7554/eLife.72264
Web of Science KeyUT	000733603500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.7554/eLife.72264

Microbial Rhodopsins as Multi-functional Photoreactive Membrane Proteins for Optogenetics

フルテキストURL	fulltext20211109-3.pdf
著者	Nakao, Shin\| Kojima, Keiichi\| Sudo, Yuki\|
キーワード	rhodopsin optogenetics retinal signal transduction
発行日	2021-10-1
出版物タイトル	Biological and Pharmaceutical Bulletin
巻	44巻
号	10号
出版者	Pharmaceutical Society of Japan
開始ページ	1357
終了ページ	1363
ISSN	0918-6158
NCID	AA10885497
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2021 The Pharmaceutical Society of Japan
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	34602542
DOI	10.1248/bpb.b21-00544
Web of Science KeyUT	000703500200002
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1248/bpb.b21-00544

Functional expression of the eukaryotic proton pump rhodopsin OmR2 in Escherichia coli and its photochemical characterization

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kikuchi, Masuzu\| Kojima, Keiichi\| Nakao, Shin\| Yoshizawa, Susumu\| Kawanishi, Shiho\| Shibukawa, Atsushi\| Kikukawa, Takashi\| Sudo, Yuki\|
発行日	2021-07-20
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	11巻
号	1号
出版者	Nature Portfolio
開始ページ	14765
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2021
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	34285294
DOI	10.1038/s41598-021-94181-w
Web of Science KeyUT	000692201200025
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-021-94181-w

Lokiarchaeota archaeon schizorhodopsin-2 (LaSzR2) is an inward proton pump displaying a characteristic feature of acid-induced spectral blue-shift

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Yoshizawa, Susumu\| Hasegawa, Masumi\| Nakama, Masaki\| Kurihara, Marie\| Kikukawa, Takashi\| Sudo, Yuki\|
発行日	2020-11-30
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	10巻
号	1号
出版者	Nature Research
開始ページ	20857
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2020
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33257762
DOI	10.1038/s41598-020-77936-9
Web of Science KeyUT	000609202800018
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-020-77936-9

Vectorial Proton Transport Mechanism of RxR, a Phylogenetically Distinct and Thermally Stable Microbial Rhodopsin

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Ueta, Tetsuya\| Noji, Tomoyasu\| Saito, Keisuke\| Kanehara, Kanae\| Yoshizawa, Susumu\| Ishikita, Hiroshi\| Sudo, Yuki\|
キーワード	Biochemistry Biophysics
発行日	2020-01-14
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	10巻
号	1号
出版者	Nature
開始ページ	282
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2020
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31937866
DOI	10.1038/s41598-019-57122-2
Web of Science KeyUT	000562803500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-019-57122-2

The Unlimited Potential of Microbial Rhodopsins as Optical Tools

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kojima, Keiichi\| Shibukawa, Atsushi\| Sudo, Yuki\|
発行日	2019-12-09
出版物タイトル	Biochemistry
巻	59巻
号	3号
出版者	American Chemical Society
開始ページ	218
終了ページ	229
ISSN	0006-2960
NCID	AA00564599
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	31815443
DOI	10.1021/acs.biochem.9b00768
Web of Science KeyUT	000510530400003
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.biochem.9b00768

Photochemical Characterization of a New Heliorhodopsin from the Gram-Negative Eubacterium Bellilinea caldifistulae (BcHeR) and Comparison with Heliorhodopsin-48C12

フルテキストURL	Biochemistry_58_26_2934.pdf
著者	Shibukawa, Atsushi\| Kojima, Keiichi\| Nakajima, Yu\| Nishimura, Yosuke\| Yoshizawa, Susumu\| Sudo, Yuki\|
備考	This fulltext will be available in Jun 2020\|
発行日	2019-05-31
出版物タイトル	Biochemistry
巻	58巻
号	26号
出版者	American Chemical Society
開始ページ	2934
終了ページ	2943
ISSN	00062960
NCID	AA00564599
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	31150215
DOI	10.1021/acs.biochem.9b00257
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1021/acs.biochem.9b00257

Quantitation of the neural silencing activity of anion channelrhodopsins in Caenorhabditis elegans and their applicability for long-term illumination

フルテキストURL	SciRep_9_7863.pdf
著者	Yamanashi, Taro\| Maki, Misayo\| Kojima, Keiichi\| Shibukawa, Atsushi\| Tsukamoto, Takashi\| Chowdhury, Srikanta\| Yamanaka, Akihiro\| Takagi, Shin\| Sudo, Yuki\|
発行日	2019-05-27
出版物タイトル	Scientific reports
巻	9巻
号	1号
出版者	Nature Publishing Group
開始ページ	7863
ISSN	20452322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31133660
DOI	10.1038/s41598-019-44308-x
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-019-44308-x

須藤 雄気