守屋央朗

過剰発現プロファイリングADOPT法を用いたS.cerevisiaeのワイン醸造用ブドウ果汁への適応性評価

タイトル（別表記）	Evaluator of adaptability of S. cerevisiae to grape juice using the oversxpression profiling ADOPT method
フルテキストURL	srfa_113_001_006.pdf
著者	守屋央朗\| 小野千由貴\|
抄録	The authors have recently developed the overexpression profiling ADOPT method. In the ADOPT method, yeast strains overexpressing most of the genes in the budding yeast Saccharomyces cerevisiae genome are mixed and competitively cultured, and the genes overexpressed in the enriched strains are systematically identified. Furthermore, the identified genes can be used to identify bottleneck factors that are necessary but lacking for growth of S. cerevisiae under given conditions. In our previous studies, we have identified bottlenecks in artificially created stress environments in the laboratory, but in this study, we used grape juice for winemaking as an example to see if industrial bottlenecks can be identified. ADOPT experiments with sulfite-added grape juice used in conventional winemaking resulted in a strong enrichment of strains overexpressing the sulfite pump SSU1 and its transcription factor FZF1. Since enhancement of SSU1 function is known to occur in wine yeast acclimation, ADOPT was also shown to be useful in the search for industrial bottlenecks. On the other hand, no genes were strongly enriched by ADOPT in grape juice without sulfite addition, suggesting that grape juice is a balanced medium with few bottlenecks for S. cerevisiae growth.
キーワード	yeast S. cerevisiae overexpression wine making
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
発行日	2024-02-01
巻	113巻
開始ページ	1
終了ページ	6
ISSN	2186-7755
言語	日本語
論文のバージョン	publisher

Demonstration of iodide-dependent UVA-triggered growth inhibition in Saccharomyces cerevisiae cells and identification of its suppressive molecules

著者	Ono, Ryota\| Saeki, Nozomu\| Kojima, Keiichi\| Moriya, Hisao\| Sudo, Yuki\|
キーワード	UVA Saccharomyces cerevisiae Iodide Growth inhibition Suppressive molecule
備考	© 2023 Elsevier Inc. This manuscript version is made available under the CC-BY-NC-ND 4.0 license https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/\| This fulltext file will be available in Oct. 2024.\|
発行日	2023-10-15
出版物タイトル	Biochemical and Biophysical Research Communications
巻	677巻
出版者	Elsevier BV
開始ページ	1
終了ページ	5
ISSN	0006-291X
NCID	AA00564395
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 Elsevier Inc.
論文のバージョン	author
PubMed ID	37523893
DOI	10.1016/j.bbrc.2023.07.048
Web of Science KeyUT	001047346900001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2023.07.048

Overexpression profiling reveals cellular requirements in the context of genetic backgrounds and environments

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Saeki, Nozomu\| Yamamoto, Chie\| Eguchi, Yuichi\| Sekito, Takayuki\| Shigenobu, Shuji\| Yoshimura, Mami\| Yashiroda, Yoko\| Boone, Charles\| Moriya, Hisao\|
発行日	2023-04-28
出版物タイトル	PLoS Genetics
巻	19巻
号	4号
出版者	Public Library of Science
開始ページ	e1010732
ISSN	1553-7404
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2023 Saeki et al.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	37115757
DOI	10.1371/journal.pgen.1010732
Web of Science KeyUT	000978623500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010732

Massive expression of cysteine-containing proteins causes abnormal elongation of yeast cells by perturbing the proteasome

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Namba, Shotaro\| Kato, Hisaaki\| Shigenobu, Shuji\| Makino, Takashi\| Moriya, Hisao\|
キーワード	yeast fluorescent protein cytotoxicity protein burden heat shock response morphology proteasome
発行日	2022-04-29
出版物タイトル	g3－Genes Genomes Genetics
巻	12巻
号	6号
出版者	Oxford Univ Press Inc.
開始ページ	jkac106
ISSN	2160-1836
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2022.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	35485947
DOI	10.1093/g3journal/jkac106
Web of Science KeyUT	000796686500001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1093/g3journal/jkac106

Genetic profiling of protein burden and nuclear export overload

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Kintaka, Reiko\| Makanae, Koji\| Namba, Shotaro\| Kato, Hisaaki\| Kito, Keiji\| Ohnuki, Shinsuke\| Ohya, Yoshikazu\| Andrews, Brenda J.\| Boone, Charles\| Moriya, Hisao\|
発行日	2020-11-04
出版物タイトル	eLife
巻	9巻
出版者	eLife Sciences Publications
開始ページ	e54080
ISSN	2050-084X
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© Kintaka et al.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33146608
DOI	10.7554/eLife.54080
Web of Science KeyUT	000592848100001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.7554/eLife.54080

Exploring the Complexity of Protein-Level Dosage Compensation that Fine-Tunes Stoichiometry of Multiprotein Complexes

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Ishikawa, Koji\| Ishihara, Akari\| Moriya, Hisao\|
発行日	2020-10-28
出版物タイトル	PLoS Genetics
巻	16巻
号	10号
出版者	Public Library of Science
開始ページ	e1009091
ISSN	1553-7404
NCID	AA12073492
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2020 Ishikawa et al.
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	33112847
DOI	10.1371/journal.pgen.1009091
Web of Science KeyUT	000588362000001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1009091

Development of an experimental method of systematically estimating protein expression limits in HEK293 cells

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Mori, Yoshihiro\| Yoshida, Yuki\| Satoh, Ayano\| Moriya, Hisao\|
キーワード	Biological techniques Cell biology Gene expression analysis Molecular biology Protein translocation Protein transport
発行日	2020-03-16
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	10巻
号	1号
出版者	Nature
開始ページ	4798
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2020
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	32179769
DOI	10.1038/s41598-020-61646-3
Web of Science KeyUT	000562125100001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-020-61646-3

N-terminal deletion of Swi3 created by the deletion of a dubious ORF YJL175W mitigates protein burden effect in S. cerevisiae

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Saeki, Nozomu\| Eguchi, Yuichi\| Kintaka, Reiko\| Makanae, Koji\| Shichino, Yuichi\| Iwasaki, Shintaro\| Kanno, Manabu\| Kimura, Nobutada\| Moriya, Hisao\|
キーワード	Cell growth Gene expression Gene regulation
発行日	2020-06-11
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	10巻
号	1号
出版者	Nature
開始ページ	9500
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2020
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	32528012
DOI	10.1038/s41598-020-66307-z
Web of Science KeyUT	000559960100018
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-020-66307-z

Comparative Gene Analysis Focused on Silica Cell Wall Formation: Identification of Diatom-Specific SET Domain Protein Methyltransferases

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Nemoto, Michiko\| Iwaki, Sayako\| Moriya, Hisao\| Monden, Yuki\| Tamura, Takashi\| Inagaki, Kenji\| Mayama, Shigeki\| Obuse, Kiori\|
キーワード	Biomineralization Diatom Silica Transcriptome Proteome
備考	This is a post-peer-review, pre-copyedit version of an article published in Marine Biotechnology. The final authenticated version is available online at: http://dx.doi.org/10.1007/s10126-020-09976-1.\|
発行日	2020-06-03
出版物タイトル	Marine Biotechnology
出版者	Springer
ISSN	1436-2228
NCID	AA11357643
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	フランス語
OAI-PMH Set	岡山大学
論文のバージョン	author
PubMed ID	32488507
DOI	10.1007/s10126-020-09976-1
Web of Science KeyUT	000537432000001
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1007/s10126-020-09976-1

The expression level and cytotoxicity of green fluorescent protein are modulated by an additional N-terminal sequence

フルテキストURL	fulltext.pdf
著者	Moriya, Hisao\|
キーワード	green fluorescent protein overexpression expression limit expression level protein cytotoxicity
発行日	2020-05-14
出版物タイトル	AIMS Biophysics
巻	7巻
号	2号
出版者	AIMS Press
開始ページ	121
終了ページ	132
ISSN	2377-9098
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© 2020 the Author(s), licensee AIMS Press.
論文のバージョン	publisher
DOI	10.3934/biophy.2020010
Web of Science KeyUT	000535774000005
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.3934/biophy.2020010

酵母2μプラスミドのコピー数変動の数理的解析

タイトル（別表記）	Mathematical analysis of copy number variation of 2 μ-based plasmids in yeast cells
フルテキストURL	srfa_109_007_011.pdf
著者	佐伯望\| 守屋央朗\|
抄録	Plasmids with the 2 μ plasmid origin are commonly-used in the genetic engineering of the budding yeast Saccharomyces cerevisiae. Intracellular copy numbers of 2 μ plasmids are different depending on the genes inserted into the plasmids. This difference is thought to occur from the difference in the growth efficiency （fitness） produced by the positive- and negative-selection biases of genes inserted in the plasmid. In this study, we made a mathematical model based on this assumption. Computational simulations of the model validated that copy numbers of the plasmids are rapidly settled depending on the fitness created by the gene on the plasmid. The copy number of a plasmid only contains a bias to keep the plasmid in a single copy became average 20copies per cell when the plasmid is randomly distributed, suggesting that no positive distribution mechanism is required for a plasmid to become multicopy.
キーワード	yeast 2 μ plasmid mathematical model
出版物タイトル	岡山大学農学部学術報告
発行日	2020-02-01
巻	109巻
開始ページ	7
終了ページ	11
ISSN	2186-7755
言語	日本語
論文のバージョン	publisher

Yeast screening system reveals the inhibitory mechanism of cancer cell proliferation by benzyl isothiocyanate through down-regulation of Mis12

フルテキストURL	SR9_1_8866.pdf
著者	Abe-Kanoh, Naomi\| Kunisue, Narumi\| Myojin, Takumi\| Chino, Ayako\| Munemasa, Shintaro\| Murata, Yoshiyuki\| Satoh, Ayano\| Moriya, Hisao\| Nakamura, Yoshimasa\|
発行日	2019-6-20
出版物タイトル	Scientific Reports
巻	9巻
出版者	Nature Publishing Group
開始ページ	8866
ISSN	2045-2322
資料タイプ	学術雑誌論文
言語	英語
OAI-PMH Set	岡山大学
著作権者	© The Author(s) 2019
論文のバージョン	publisher
PubMed ID	31222108
DOI	10.1038/s41598-019-45248-2
Web of Science KeyUT	000472136900040
関連URL	isVersionOf https://doi.org/10.1038/s41598-019-45248-2

守屋 央朗