start-ver=1.4
cd-journal=joma
no-vol=
cd-vols=
no-issue=
article-no=
start-page=
end-page=
dt-received=
dt-revised=
dt-accepted=
dt-pub-year=2013
dt-pub=20130325
dt-online=
en-article=
kn-article=
en-subject=
kn-subject=
en-title=
kn-title=Acidithiobacillus ferrooxidansのチオ硫酸代謝経路の解析
en-subtitle=
kn-subtitle=
en-abstract=
kn-abstract=
en-copyright=
kn-copyright=

en-aut-name=KikumotoMei
en-aut-sei=Kikumoto
en-aut-mei=Mei
kn-aut-name=菊本愛生
kn-aut-sei=菊本
kn-aut-mei=愛生
aut-affil-num=1
ORCID=

affil-num=1
en-affil=
kn-affil=岡山大学
END

start-ver=1.4
cd-journal=joma
no-vol=104
cd-vols=
no-issue=
article-no=
start-page=5
end-page=12
dt-received=
dt-revised=
dt-accepted=
dt-pub-year=2015
dt-pub=20150201
dt-online=
en-article=
kn-article=
en-subject=
kn-subject=
en-title=好酸性鉄酸化細菌 Acidithiobacillus ferrooxidans の染色体凝集・分配タンパク質（ScpB）の性質
kn-title=Characterization of a putative chromosome segregation and condensation protein (ScpB) in an acidophilic iron‒oxidizing bacterium Acidithiobacillus ferrooxidans
en-subtitle=
kn-subtitle=
en-abstract=　Acidithiobacillus ferrooxidans は，低品位の銅鉱石から銅を回収するバイオリーチングにおいて使用される微生物
の一つである．この細菌は，エネルギー源として二価鉄イオンや還元型無機硫黄化合物（RISC）を使用する．鉄の酸化に関与する遺伝子の転写は，A. ferrooxidans が RISC で生育したときには抑制されるが，RISC の酸化に関与すると考えられている遺伝子の転写は活性化されることが知られている．硫黄やテトラチオン酸で生育したときにその発現が上方制御される硫化水素：キノン酸化還元酵素のすぐ上流に，ヘリックスターンへリックスモティーフを持つ，ScpB と推定されるタンパク質をコードする遺伝子が存在していた．鉄，硫黄，テトラチオン酸生育細胞から調製した cDNA を用いた半定量的 PCR 分析の結果，硫黄やテトラチオン酸で生育した細胞内の scpB 遺伝子の転写は，鉄生育細胞と比較すると上方制御されていた．組換え ScpB タンパク質を用いたゲルシフトアッセイ法で，ScpB
が転写制御因子として機能するかどうかを調べた．その結果，ScpB は DNA に結合したが，結合の特異性はなかった．ScpB が直接 DNA と相互作用する報告はこれまでになかった．
kn-abstract=　Acidithiobacillus ferrooxidans is one of the most widely used microorganisms in bioleaching operations to recover copper from low-grade copper sulfide. This bacterium uses ferrous iron and reduced inorganic sulfur compounds (RISCs) as energy sources. Transcriptions of genes thought to be involved in the oxidation of RISCs have been known to be highly activated in A. ferrooxidans cells grown on RISCs, while transcriptions of genes involved in the iron oxidation were repressed in the cells grown on
RISCs. A gene encoding a putative chromosome segregation and condensation protein (ScpB) with a
helix-turn-helix motif was found in the upstream region of sulfide : quinone oxidoreductase gene, whose expression was up-regulated in cells grown in sulfur and tetrathionate. A semi-quantitative PCR analysis using cDNA prepared from iron-, sulfur-, or tetrathionate-grown cells revealed that the transcription of scpB was up-regulated in cells grown on sulfur or tetrathionate as the energy source. Electrophoretic mobility shift assays were employed to examine whether the ScpB functions as a transcription factor. The result indicated that the recombinant His-tagged ScpB protein was able to nonspecifically bind in
vitro to DNA. This is the first report on a direct association of ScpB with DNA.
en-copyright=
kn-copyright=

en-aut-name=KamimuraKazuo
en-aut-sei=Kamimura
en-aut-mei=Kazuo
kn-aut-name=上村一雄
kn-aut-sei=上村
kn-aut-mei=一雄
aut-affil-num=1
ORCID=

en-aut-name=NagataNozomu
en-aut-sei=Nagata
en-aut-mei=Nozomu
kn-aut-name=長田臨
kn-aut-sei=長田
kn-aut-mei=臨
aut-affil-num=2
ORCID=

en-aut-name=KikumotoMei
en-aut-sei=Kikumoto
en-aut-mei=Mei
kn-aut-name=菊本愛生
kn-aut-sei=菊本
kn-aut-mei=愛生
aut-affil-num=3
ORCID=

en-aut-name=SharminSultana
en-aut-sei=Sharmin
en-aut-mei=Sultana
kn-aut-name=
kn-aut-sei=
kn-aut-mei=
aut-affil-num=4
ORCID=

en-aut-name=WakaiSatoshi
en-aut-sei=Wakai
en-aut-mei=Satoshi
kn-aut-name=若井暁
kn-aut-sei=若井
kn-aut-mei=暁
aut-affil-num=5
ORCID=

en-aut-name=KanaoTadayoshi
en-aut-sei=Kanao
en-aut-mei=Tadayoshi
kn-aut-name=金尾忠芳
kn-aut-sei=金尾
kn-aut-mei=忠芳
aut-affil-num=6
ORCID=

affil-num=1
en-affil=
kn-affil=岡山大学大学院環境生命科学研究科

affil-num=2
en-affil=
kn-affil=岡山大学大学院環境生命科学研究科

affil-num=3
en-affil=
kn-affil=岡山大学大学院環境生命科学研究科

affil-num=4
en-affil=
kn-affil=岡山大学大学院環境生命科学研究科

affil-num=5
en-affil=
kn-affil=神戸大学自然科学系先端融合研究環

affil-num=6
en-affil=
kn-affil=神戸大学自然科学系先端融合研究環
en-keyword=Acidithiobacillus ferrooxidans
kn-keyword=Acidithiobacillus ferrooxidans
en-keyword=Acidophile
kn-keyword=Acidophile
en-keyword=ScpB
kn-keyword=ScpB
en-keyword=transcription factor
kn-keyword=transcription factor
END